J'ai ajouté dans mon document [sorting=none]{biblatex}, mais ma bibliographie reste désordonnée :

Ouvrir dans l'éditeur Overleaf
\documentclass[12pt,space=onehalf,fncychap=Bjornstrup]{yathesis}

\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage{kpfonts}
\usepackage{booktabs}
\usepackage{pdfpages}
\usepackage{siunitx}
\usepackage{lipsum}
\usepackage{pgfplots}
\usepackage{floatrow}
\usepackage{caption}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{listings}
\usepackage{microtype}
\usepackage{varioref}
\usepackage{array}
\usepackage{xcolor}
\usepackage[xindy,quiet]{imakeidx}
\usepackage[autostyle]{csquotes}
\usepackage[backend=biber,safeinputenc, sorting=none]{biblatex}
\usepackage{hyperref}
\usepackage[xindy,acronyms,symbols]{glossaries}
\addbibresource{bibliographie/biblthese.bib}
\begin{document}

     \section{Historique}
 par Villiers en 1891 \autocite{villiers__1891}.
 blabla
 fut isolé 20 ans plus tard par Schardinger \autocite{__????}. 
\section*{}
C'est en 1932 que Prigsheim démontre que ces produits avaient la propriété de former des complexes avec les molécules organiques \autocite{__????-2}. des complexes d'inclusion fut posé \autocite{freudenberg_uber_1938}.
S'ensuivent de nombreux travaux qui permettront de déterminer leur structure chimique ainsi que leurs propriétés d'inclusion \autocite{loftsson_cyclodextrins_2007}.
\section*{}
C’est avec les travaux de Cramer dans les années 1950 sur leurs production enzymatique,Freudenberg (\autocite{freudenberg_uber_1938}) qui démontrent que les cyla pharmacie, la cosmétique, l’agroalimentaire \dots \autocite{szejtli_utilization_1997}
\section{Structures et nomenclatures des }
Il existe principalement 3 familles  laboratoire) \autocite{_pq089904246p_????}. 
     \printbibliography
\end{document}

Bibliographie :

Ouvrir dans l'éditeur Overleaf
    @article{villiers__1891,
  timestamp = {2016-07-08T10:22:30Z},
  journaltitle = {C. R. Acad. Sci.},
  journalsubtitle = {112},
  author = {Villiers, A.},
  date = {1891},
  pages = {536--538}
}
@article{__????,
  timestamp = {2016-07-08T16:02:51Z},
  journaltitle = {Zentralbl. Bakteriol. Parasintenkd},
  journalsubtitle = {14},
  author = {Schardinger, F.},
  date = {1905},
  pages = {772--781}
}
@article{__????-2,
  timestamp = {2016-07-08T20:04:19Z},
  journaltitle = {Chemistry of the Saccharides},
  author = {Pringsheim, H.},
  date = {1992},
  pages = {280}
}
@article{freudenberg_uber_1938,
  title = {Über die {{Schardinger}} - {{Dextrine}} aus {{Stärke}}},
  volume = {71},
  issn = {1099-0682},
  doi = {10.1002/cber.19380710809},
  timestamp = {2016-07-08T14:23:45Z},
  number = {8},
  journaltitle = {Berichte der deutschen chemischen Gesellschaft (A and B Series)},
  shortjournal = {Ber. dtsch. Chem. Ges. A/B},
  author = {Freudenberg, Karl and Meyer-Delius, Margot},
  date = {1938-08-03},
  pages = {1596--1600}
}
@article{loftsson_cyclodextrins_2007,
  title = {Cyclodextrins and their pharmaceutical applications},
  volume = {329},
  issn = {0378-5173},
  doi = {10.1016/j.ijpharm.2006.10.044},
  timestamp = {2016-08-22T13:06:37Z},
  langid = {english},
  number = {1–2},
  journaltitle = {International Journal of Pharmaceutics},
  shortjournal = {International Journal of Pharmaceutics},
  author = {Loftsson, Thorsteinn and Duchêne, Dominique},
  date = {2007-02-01},
  pages = {1--11},
  keywords = {Complexation,Cyclodextrin,Drug delivery,Formulation,History,Regulatory,Toxicology}
}
@article{szejtli_utilization_1997,
  title = {Utilization of cyclodextrins in industrial products and processes},
  volume = {7},
  issn = {09599428, 13645501},
  doi = {10.1039/a605235e},
  timestamp = {2016-07-08T12:10:45Z},
  number = {4},
  journaltitle = {Journal of Materials Chemistry},
  author = {Szejtli, József},
  date = {1997},
  pages = {575--587}
}
@article{_pq089904246p_????,
  title = {V-{{Amylose}} at atomic resolution: {{X}}-ray structure of a cycloamylose with 26 glucose residues (cyclomaltohexaicosaose)},
  volume = {96},
  url = {http://www.pnas.org/content/96/8/4246.full.pdf},
  timestamp = {2016-07-08T20:17:45Z},
  author = {Gessler, Katrin},
  date = {1999},
  pages = {4246--4251}
}

Posée 24 Aoû '16, 18:39

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AurélienCocq
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Taux d'acceptation : 9%

Modifiée 05 Aoû '17, 22:57

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Pathe ♦♦
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sorting=none= bibliographie non ordonnée mais suivant l'ordre de citation.

Vous pouvez par exemple utiliser: sorting=nty ordonnée suivant auteur(name), titre(title), année(year). ou sorting=nyt ou sorting=ynt ...

(24 Aoû '16, 19:05) touhami touhami's gravatar image

Je pense que c'est un problème de configuration de TeXstudio : il faut redemander que l'outil de bibliographie par défaut soit biber, comme sur la capture d'écran ci-jointe.

Aussi, penser à demander que le fichier que vous compilez soit déclaré fichier-maître : s'il y a déjà un fichier-maître différent, c'est lui que vous compilerez.

Lien permanent

Publiée 25 Aoû '16, 16:26

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Bernard
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Modifiée 30 Nov '17, 01:33

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Pathe ♦♦
4.5k138126

sa ne change rien non plus entre bilatex ou biber, j'ai l'impression que le problème est que le fichier bbl est toujours mal rempli. En effet, avec biber il ne s'est pas effacé contrairement a biblatex mais j'ai pu constaté qu'après compilation, la modification de nty en none avais disparue

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Processus en cours : "C:/texlive/2016/bin/win32/biber.exe" "Manuscrit"

INFO - This is Biber 2.5
INFO - Logfile is 'Manuscrit.blg'
INFO - Reading 'Manuscrit.bcf'
INFO - Found 41 citekeys in bib section 0
INFO - Processing section 0
INFO - Looking for bibtex format file 'bibliographie/biblthese.bib' for section 0
INFO - Decoding LaTeX character macros into UTF-8
INFO - Found BibTeX data source 'bibliographie/biblthese.bib'
INFO - Overriding locale 'fr-FR' defaults 'normalization = NFD' with 'normalization = prenormalized'
INFO - Overriding locale 'fr-FR' defaults 'variable = shifted' with 'variable = non-ignorable'
INFO - Sorting list 'nty/global/' of type 'entry' with scheme 'nty' and locale 'fr-FR'
INFO - Writing 'Manuscrit.bbl' with encoding 'UTF-8'
INFO - Output to Manuscrit.bbl

Processus terminé normalement
(25 Aoû '16, 17:03) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image
1

Il y a là plusieurs problèmes. 1) Il n'y a pas à choisir entre biblatex et biber: le premier est une extension latex, destinée à assurer la mise en forme de la bibliographie. Le second est un fichier exécutable, qui sert à préparer le travail de biblatex. Les deux sont faits pour fonctionner de concert. 2) Vous n'avez pas compilé le code posté sur le site, mais un code probablement plus complet (41 citations!). Le premier travail pour essayer de cerner le problème est compiler le code posté et rien que lui. S'il donne le résultat souhaité, ça prouvera que le problème est ailleurs.

(25 Aoû '16, 17:44) Bernard Bernard's gravatar image

J'ai les memes résultats ... avec l'editeur embarqué par de problèmes mais quelque soit le [sorting] que je choisis pour texstudio rien ne change

(25 Aoû '16, 18:05) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image

Vous ne répondez pas exactement à ma question: est-ce que vous avez compilé exactement le code posté et nul autre (avec sorting=none, bien sûr)?

(25 Aoû '16, 18:11) Bernard Bernard's gravatar image

celui posté par touhami, oui. sans modifications

(25 Aoû '16, 18:17) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image

j'ai utilisé le meme que celui posté par touhami, j'ai par contre du mettre la bibliographie dans un fichier .Bib a part car décrit comme cela, il ne trouvais pas le fichier mybib.bib

(25 Aoû '16, 18:22) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image

J'ai aussi compilé celui de touhami (initialement, j'avais compilé le vôtre), mais de toute façon, le fichier .blg que vous avez posté en commentaire ne correspond pas à celui de touhami, qui ne comporte que 7 citations. D'ailleurs, avez-vous appelé le fichier de touhami Manuscrit? Je soupçonne une histoire de fichier-maître.

(25 Aoû '16, 18:54) Bernard Bernard's gravatar image

J'ai complété ma réponse.

(25 Aoû '16, 19:06) Bernard Bernard's gravatar image

..............

(25 Aoû '16, 19:09) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image

j'ai utilisé le meme que celui posté par touhami, j'ai par contre du mettre la bibliographie dans un fichier .Bib a part car décrit comme cela, il ne trouvais pas le fichier mybib.bib

(25 Aoû '16, 19:09) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image
Affichage de 5 parmi 10 Afficher 5 commentaire(s) en plus

Il y a plusieurs façons pour trier les référence bibliographiques ; citons entre autres :

nty trier par auteur(name), titre(title), année(year).

nyt trier par auteur année titre.

ynt trier par année auteur titre.

nyvt trier par auteur année volume titre.

ydnt trier par année (décroissante), auteur, titre.

none suivant l'ordre de citation dans le corps de texte.

Ouvrir dans l'éditeur Overleaf
\documentclass{article}

\begin{filecontents}{mybib.bib}
 @article{villiers__1891,
  timestamp = {2016-07-08T10:22:30Z},
  journaltitle = {C. R. Acad. Sci.},
  journalsubtitle = {112},
  author = {Villiers, A.},
  date = {1891},
  pages = {536--538}
}
@article{__????,
  timestamp = {2016-07-08T16:02:51Z},
  journaltitle = {Zentralbl. Bakteriol. Parasintenkd},
  journalsubtitle = {14},
  author = {Schardinger, F.},
  date = {1905},
  pages = {772--781}
}
@article{__????-2,
  timestamp = {2016-07-08T20:04:19Z},
  journaltitle = {Chemistry of the Saccharides},
  author = {Pringsheim, H.},
  date = {1992},
  pages = {280}
}
@article{freudenberg_uber_1938,
  title = {Über die {{Schardinger}} - {{Dextrine}} aus {{Stärke}}},
  volume = {71},
  issn = {1099-0682},
  doi = {10.1002/cber.19380710809},
  timestamp = {2016-07-08T14:23:45Z},
  number = {8},
  journaltitle = {Berichte der deutschen chemischen Gesellschaft (A and B Series)},
  shortjournal = {Ber. dtsch. Chem. Ges. A/B},
  author = {Freudenberg, Karl and Meyer-Delius, Margot},
  date = {1938-08-03},
  pages = {1596--1600}
}
@article{loftsson_cyclodextrins_2007,
  title = {Cyclodextrins and their pharmaceutical applications},
  volume = {329},
  issn = {0378-5173},
  doi = {10.1016/j.ijpharm.2006.10.044},
  timestamp = {2016-08-22T13:06:37Z},
  langid = {english},
  number = {1–2},
  journaltitle = {International Journal of Pharmaceutics},
  shortjournal = {International Journal of Pharmaceutics},
  author = {Loftsson, Thorsteinn and Duchêne, Dominique},
  date = {2007-02-01},
  pages = {1--11},
  keywords = {Complexation,Cyclodextrin,Drug delivery,Formulation,History,Regulatory,Toxicology}
}
@article{szejtli_utilization_1997,
  title = {Utilization of cyclodextrins in industrial products and processes},
  volume = {7},
  issn = {09599428, 13645501},
  doi = {10.1039/a605235e},
  timestamp = {2016-07-08T12:10:45Z},
  number = {4},
  journaltitle = {Journal of Materials Chemistry},
  author = {Szejtli, József},
  date = {1997},
  pages = {575--587}
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@article{_pq089904246p_????,
  title = {V-{{Amylose}} at atomic resolution: {{X}}-ray structure of a cycloamylose with 26 glucose residues (cyclomaltohexaicosaose)},
  volume = {96},
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  author = {Gessler, Katrin},
  date = {1999},
  pages = {4246--4251}
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%\usepackage[backend=biber,safeinputenc, sorting=ynt]{biblatex}
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\addbibresource{mybib.bib}
\begin{document}

     \section{Historique}
 par Villiers en 1891 \autocite{villiers__1891}.
 blabla
 fut isolé 20 ans plus tard par Schardinger \autocite{__????}. 
\section*{}
C'est en 1932 que Prigsheim démontre que ces produits avaient la propriété de former des complexes avec les molécules organiques \autocite{__????-2}. des complexes d'inclusion fut posé \autocite{freudenberg_uber_1938}.
S'ensuivent de nombreux travaux qui permettront de déterminer leur structure chimique ainsi que leurs propriétés d'inclusion \autocite{loftsson_cyclodextrins_2007}.
\section*{}
C’est avec les travaux de Cramer dans les années 1950 sur leurs production enzymatique,Freudenberg (\autocite{freudenberg_uber_1938}) qui démontrent que les cyla pharmacie, la cosmétique, l’agroalimentaire \dots \autocite{szejtli_utilization_1997}
\section{Structures et nomenclatures des }
Il existe principalement 3 familles  laboratoire) \autocite{_pq089904246p_????}. 
     \printbibliography
\end{document}
Lien permanent

Publiée 24 Aoû '16, 20:00

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touhami
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Modifiée 05 Aoû '17, 23:07

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Pathe ♦♦
4.5k138126

Je les voudraient justement dans la bibliographie dans l'ordre de citation dans le texte afin d'avoir les numéros de reference dans l'ordre. c'est pour cela que j'ai rajouté sorting=none mais ma bibliographie ne se met pas a jour et je ne sait pas d'où viens le problème ...

(25 Aoû '16, 00:55) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image

Supprimer les fichiers auxiliaires et refaire la compilation.

(25 Aoû '16, 02:30) touhami touhami's gravatar image

Je ne connais pas tres bien latex, lesquels dois je supprimer ?

(25 Aoû '16, 12:01) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image

Rien ne change , mêm en le faisant en ajoutant progressivement les differentes parties de mon document, cela reste toujours désordonné ...

(25 Aoû '16, 13:01) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image

Rien ne change, je pense à un problème avec Texstudio, car lorsque j'ouvre votre reponse dans overleaf sa marche mais dès que je la colle dans Texstudio, sa ne change pas quelque soit l'argument du package biblatex

(25 Aoû '16, 13:17) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image

TeXstudio n'est qu'un éditeur de texte spécialisé. Ce n'est pas lui qui compile, et et il n'est évidemment pas responsable des problèmes à la compilation. Quelle est votre version de biblatex et de biber?

(25 Aoû '16, 13:28) Bernard Bernard's gravatar image

c'est aussi ce que je me dis mais je ne comprends pas pourquoi cela change selon l'editeur. Texstudio version 2.11.0 utilisant la texlive 2016

(25 Aoû '16, 13:36) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image

Chez moi, il n'y a aucun problème (MiKTeX à jour + WinEdt). Est-ce que vous avez le problème avec le code que vous avez posté lui-même?

(25 Aoû '16, 14:20) Bernard Bernard's gravatar image

Que sa soit ma version ou celle publiee en reponse, a chaque fois que je change le sorting, la biblio reste telle quelle... pourtant tout est a jour aussi chez moi.

(25 Aoû '16, 14:26) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image

Que sa soit ma version ou celle publiee en reponse, a chaque fois que je change le sorting, la biblio reste telle quelle... pourtant tout est a jour aussi chez moi.

(25 Aoû '16, 14:26) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image

Avez-vous supprimé tous les fichiers auxiliaires (manuellement, au besoin, je ne sais pas trop comment TeXstudio fonctionne)? Aussi, avant de supprimer quoi que ce soit, vérifiez le contenu du fichier .bbl: j'ai, ligne 21 (indicatif: j'utilise MiKTeX) \sortlist[entry]{none/global/}. Si vous avez, par exemple, nyt/global, remplacez à la main nyt par none, enregistrez et recompilez pour voir ce qu'il se passe.

(25 Aoû '16, 14:33) Bernard Bernard's gravatar image

@AurélienCocq Il faut s'assurer de la compilation: (xe ou pdf)latex + biber + (xe ou pdf)latex + (xe ou pdf)latex parce que pour Texstudio bibtex et biber sont différents.

(25 Aoû '16, 15:18) touhami touhami's gravatar image

@Touhami Lors de ma formation on nous avais demandé de modifier pour mettre la compilation selon bibtex. Normalement Texstudio fait automatiquement toutes les suites de compilations. @Bernard Effectivement rien ne change dans le fichier bbl mais quand je change manuellement, les references biblographiques passent des numéros aux clés affichées en gras et le fichier bbl se vide apres la nouvelle compilation

(25 Aoû '16, 16:13) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image

sa ne change rien non plus entre bilatex ou biber, j'ai l'impression que le problème est que le fichier bbl est toujours mal rempli. En effet, avec biber il ne s'est pas effacé contrairement a biblatex mais j'ai pu constaté qu'après compilation, la modification de nty en none avais disparue

(25 Aoû '16, 16:58) AurélienCocq Aur%C3%A9lienCocq's gravatar image
2

@AurélienCocq À mon avis de préférence de poster une nouvelle question à propos de la compilation et/ou la configuration de TeXstudio.

(25 Aoû '16, 20:41) touhami touhami's gravatar image
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Question posée : 24 Aoû '16, 18:39

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Dernière mise à jour : 25 Aoû '16, 20:43