Voir par exemple la page 84 de la doc de *pgfplots* :
`x tick label style={/pgf/number format/1000 sep=}`
sep=}` ou `tick label style={/pgf/number format/1000 sep=}`.
\documentclass{scrartcl}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{tikz}
\usepackage{pgfplots}
%\usepgfplotslibrary{dateplot}. Semble ne pas être accepté
\begin{filecontents}{data2.txt}
Date Precip
2000 500
2001 400
2002 600
2003 300
2004 1000
2005 700
2006 500
2007 400
\end{filecontents}
\begin{document}
\begin{tikzpicture}
\begin{axis}[
axis lines=center,
extra x ticks=0,
x tick label style={/pgf/number format/1000 sep=},
grid=major,]
\addplot
table[x=Date,y=Precip]{data2.txt};
\end{axis}
\end{tikzpicture}
\end{document}
