Ce n'est pas `yathesis` qui ajoute ce cadre, mais la commande `\floatsetup[figure]{style=BOXED}` (ceci fourni par le package `floatrow`) présente dans les spécimens le spécimen `these.tex` ou son fichier de configuration afférent `thesis.cfg,` desquels vous avez dû partir.partir. Il devrait donc suffire de commenter ou supprimer cette commande pour que les figures ne soient plus encadrées.
