Comme le dit @Bernard, il y débordement des *tikzpictures* (indiqués avec les avertissements : `Overfull \hbox (51.90787pt too wide) in paragraph at lines 49--50 )`. Donc avec l'option *scale* de *tikz* que l'on peut passer directement à l'environnement `\begin{tikzpicture}[scale=0.75]`. Il y aussi une espace parasite entre les deux environnements `\begin{subfigure}` en supprimant cette espace parasite on peut passer l'option `.5\linewidth` sans débordement.
J'ai rajouté `\pgfplotsset{compat=1.15}` comme demandé dans le fichier *.log* (Il est important de lire et comprendre ces avertissements : voir [ici][1])
**Important :** l'extension *subfigure* est obsolète, voir le [CTAN][2]. J'utiliserai plutôt l'extension *subfig*.
\documentclass{yathesis}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage{pgfplots}
\pgfplotsset{compat=1.15}
\usepackage{subfig}%\usepackage{floatrow}
\begin{document}
\begin{figure}
\begin{center}
\subfloat[OSS-$\alpha$-CD-(DOM-{[1]}-Me)1,6]{
\begin{tikzpicture}[scale=0.75]
\begin{semilogxaxis}[
xlabel=Taille (nm),
ylabel=Intensité (\%)
]
\addplot coordinates {
(0,1) (1,10) (2,100)
};
\end{semilogxaxis}
\end{tikzpicture}
}
\subfloat[OSS-$\alpha$-CD-(DOM-{[1]}-Na)1,5]{
\begin{tikzpicture}[scale=0.75]
\begin{semilogxaxis}[
xlabel=Taille (nm),
ylabel=Intensité (\%)
]
\addplot coordinates {%
(0,1) (1,10) (2,100)
};
\end{semilogxaxis}
\end{tikzpicture}
}
\end{center}
\begin{center}
\subfloat[OSS-$\beta$-CD-(DOM-{[1]}-Me)1,6]{%
\begin{tikzpicture}[scale=0.75]%
\begin{semilogxaxis}[%
xlabel=Taille (nm),
ylabel=Intensité (\%)
]%
\addplot coordinates {
(0,1) (1,10) (2,100)
};
\end{semilogxaxis}
\end{tikzpicture}
}
\end{center}
\caption{Analyses de tensiométrie de différentes OSS-CDs}
\label{tensiom}
\end{figure}
\end{document}
Il n'y a plus de débordement et les légendes sont centrées. (si elle n'y paraissent pas c'est dû à l'axe de gauche et sa légende. Regardez ce que l'on obtient en mettant dans une `\fbox`
![][3]
Les légendes sont bien centrées.
Dernier détail, il faut mettre les crochets des légendes entre deux accolades (`{[1]}`) sinon le crochet fermant est interprété comme la fin du texte de la légende.
[1]: https://latex.developpez.com/faq/avertissements/
[2]: https://ctan.org/pkg/subfigure
[3]: http://texnique.fr:80/osqa/upfiles/fig.PNG