J'ai du me résoudre à installer `TeXlive` à la place de `MiKTeX` (sans même réinstaller `TeXstudio`) et en effet le la nouvelle version 3 du package `minted` fonctionne normalement. Avec la version 3 plus besoin de compiler avec l'option --shell-escape
.... 3 bonnes heures pour l'installation de `TeXlive`
J'ai désinstallé `MiKTeX` (il y a une commande interne à MiKTeX pour cela) avant d'installer `TeXlive` parce que je ne sais pas si cela provoque des problèmes d'avoir les deux en même tempstemps, ni comment on peut basculer entre les deux même si ca ne cause pas de problèmes.