Pour effacer tous les fichiers auxiliaires générés par la compilation de `toto.tex`, il suffit de lancer l'une des commandes `latexmk -c toto` ou `latexmk -C toto`, la 2<sup>e</sup> supprimant aussi le fichier `toto.pdf`.
Les fichiers auxiliaires non prévus par défaut par `latexmk` peuvent être stipulés par leur extension dans le fichier de configuration `.latexmkrc` (à créer au besoin). Dans le mien se trouve ainsi :
@generated_exts = qw(db* listing tcbtemp aux idx ind lof lot out toc acn acr alg glg* glo* gls* ins sbl slg sym ist run.xml xdy lol fls unq synctex.gz mw sta vrb thm __nwejm.bib nav snm bcf *~);
**Mise à jour :** L'emplacement du fichier `.latexmkrc` détermine sa portée : pour
- **pour une portée globale pour l'utilisateur en cours, le mieux est de placer ce fichier cours :**
- à la racine du « TEXMFHOME » (si la distribution TeX utilisée est la TeX Live) à déterminer comme indiqué au 1er 1<sup>er</sup> item n°1 de [cette réponse][1].
réponse][1] ;
- je ne sais pas où pour la distribution MiKTeX
- **pour une portée locale à un dossier donné :** à la racine dudit dossier.
Par ailleurs, `latexmk` n'a pas pour seul but de supprimer tous les fichiers auxiliaires, loin s'en faut : son but premier est de lancer automatiquement toutes les compilations (`latex` ou `pdflatex` ou `xelatex` ou `lualatex`, `bibtex` ou `biber`, `makeglossaries`, `makeindex` ou `texindy`, etc.) nécessaires et suffisantes à l'obtention d'un document à jour.
Plus de détails sur `latexmk` par exemple [ici][2].
[1]: http://texnique.fr:80/osqa/questions/169/installation-dextension/170
[2]: http://geekographie.maieul.net/79