Une autre proposition, qui contourne la difficulté : remplacer l'expression de "referees" et "guests" :
% !TEX none
\expression{referees}{Rapporteur\textperiodcentered{}e\textperiodcentered{}}{Referee}%
\expression{guests}{Invit\'e\textperiodcentered{}e\textperiodcentered{}}{Guest}%
La version ainsi proposée transforme le pluriel dans sa forme dite inclusive
ECM.
\documentclass[nomakeabstract, notableofcontents,noprintbibliography, version=final]{yathesis}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\expression{referees}{Rapporteur\textperiodcentered{}e\textperiodcentered{}}{Referee}%
\expression{guests}{Invit\'e\textperiodcentered{}e\textperiodcentered{}}{Guest}%
\begin{document}
% métadonnées
\author{paulc}{paulc}
\title[title]{titre}
\academicfield[latex]{LateX}
\institute{Université}
\doctoralschool{ED}
\laboratory{Labo}{Labo}
\date{25}{12}{2022}
\submissiondate{25}{10}{2022}
\keywords{keywords}{motscles}
%%%%%%% Encadrants
\supervisor[corps=professor]{prenom}{nom}
\comonitor[corps=associateprofessor]{prenom2}{nom2}
%%%%%% Rapporteurs
\referee[corps=juniorresearcher*]{Truc}{Muche}
\referee[corps=professor,female=true]{Machine}{Bidule}
%%%%%% Examinateurs
\examiner[corps=professor]{Machin}{Chose}
\examiner[corps=associateprofessor]{Truc}{Bidule}
%%%%%% Invités
\guest[corps=associateprofessor, female=true]{Machine2}{Bidule2}
\guest[corps=associateprofessor]{Truc2}{Muche2}
\maketitle
\mainmatter
\end{document}
