Attention, l'ECM ci-dessus ne met pas du tout en évidence le problème, contrairement au suivant, tiré des spécimens fournis avec la classe :
\documentclass{yathesis}
\documentclass{article}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{kpfonts} % Police fournissant des petites capitales grasses
\usepackage[acronyms, symbols, toc]{glossaries}
% Génération du glossaire
\makeglossaries
%
% (Facultatif) Configuration des styles du glossaire et de la liste d'acronymes
% (à n'utiliser que si le package « glossaries » est chargé)
\setglossarystyle{indexhypergroup}
\setacronymstyle{long-sc-short}
%
\newacronym{acr}{ACR}{acronyme supplémentaire}
\newacronym{pres}{pres}{pole de recherche}
%
\begin{document}
\printacronyms
%
\gls{pres}
\newpage
\gls{acr}
\end{document}
La question posée n'est en fait pas liée à `yathesis` mais à l'usage du package `glossaries` :
- La présence de la liste des lettres vient du style `indexhypergroup`. Le remplacer par `indexgroup` par exemple suffit pour ne pas faire figurer cette liste.
- La présence des numéros de page peut être désactivée au moyen de l'option `nonumberlist` passée au package `glossaries`.